高智商悍匪龍志強(梁家輝 飾)，在香港回歸前，乘港英政府不作為，而屢犯巨案。先後綁架富豪利家及雷家之長子，勒索超過二十五億元。事主怕被報復，交贖款後承諾不報警，讓龍志強及其團隊一直逍遙法外。中港兩地警方極為關注，委派香港警方臥底何天(古天樂 飾)潛入龍的犯罪團 夥。何天智勇雙全，經多次考驗才成功接近...

故事講述神秘生物學研究所 – 君主(Monarch)派遣成員與巨獸，包括威武的哥斯拉、摩斯拉(Mothra)、拉頓(Rodan)、及哥斯拉的最強宿敵王者基多拉(Ghidorah)正面開戰。這些被認為只是傳說的遠古超級生物再度崛起，群起爭取地球主權，令人類的存亡面臨空前危機…...